中国人民解放军海军工程大学科研机构截至2014年，学校有“电力电子技术应用研究所”等15个重点研究机构，其中国家级重点实验室1个，国家级新能源研发中心1个，全军重点实验室2个，海军重点实验室1个
国家级重点实验室（1个）：舰船综合电力技术国防科技重点实验室 国家级新能源研发中心（1个）：国家能源新能源接入设备研发（实验）中心
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