中国医学科学院阜外医院深圳医院医疗设备医院现拥有先进的的心血管专业诊疗设备：3.0核磁共振（MR）、GE高端CT、西门子新双源螺旋CT、西门子高端X线数字减影成像系统（DSA）、四维心脏彩色多普勒超声诊断仪、3D胸腔镜、血管内超声（IVUS）、冠脉生理评介系统（FFR）、冠脉高速旋磨机、64通道多导电生理记录仪、射频消融仪、人工心脏机、人工心肺机、CARTO三维电生理标测系统、体外膜肺氧合系统（ECMO）、全高清胸腔镜系统、、血液回收浓缩系统等
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