中国科学院近代物理研究所学科建设截至2019年9月，近代物理研究所有2个一级学科博士学位培养点，1个二级学科博士学位培养点，2个一级学科硕士学位培养点，1个二级学科硕士学位培养点，4个专业学位硕士培养点，2个博士后科研流动站，2个中国科学院重点学科专业
一级学科博士学位培养点：物理学、核科学与技术二级学科博士学位培养点：生物物理学一级学科硕士学位培养点：物理学、核科学与技术二级学科硕士学位培养点：生物物理学专业学位硕士培养点：电子信息、材料与化工、能源动力、生物与医药
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