中国水产科学研究院黄海水产研究所设施资源设备仪器据2017年1月研究所官网显示，研究所网络管理中心具有网络IBM服务器、CISCO交换机、防火墙等硬件设备，采用了100M高速宽带网连接INTERNET，提供了多种访问服务及安全策略
研究所拥有高效液相色谱仪 HPLC、总有机碳分析仪 TOC、离子色谱、流式细胞仪、凝胶、一体化高通量基因分型平台、微生物反应器工作站、正置显微镜、生物分子成像、透射电镜、走航CO2等，拥有海洋渔业资源科学调查船“北斗”号、近岸渔业资源与环境调查船“黄海星”号
馆藏资源据2017年1月研究所官网显示，研究所图书馆藏书10万余册
其中，中外文图书6.5万册；中外期刊1000余种，3.5万册
与世界上25个国家和地区100余个单位建立了文献交换关系，每年交换期刊约150种
拥有多种光盘数据库和网上数据库等电子资源
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