上海市动物疫病预防控制中心组织结构中心共有人员编制100名
中心内设有防疫物资科、动物防疫科、兽医公共卫生科、动物疫情测报科、兽医疾病诊断中心、兽药饲料检测中心、畜牧科、宣教科、质量技术科、办公室、人事科、财务科等12个职能科室
上海市动物疫病预防控制中心实验室和上海市兽药饲料检测所实验室均通过了计量认证和国家实验室认可
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