甘肃省信息中心内设机构内设办公室、党委办公室、监察室、综合业务处、公共技术服务处、计算机网络处、信息资源开发处、经济预测处、国土与地区经济研究室、国民经济与社会发展研究室等10个职能处室
另有机关服务中心、国家经济信息系统兰州培训中心（甘肃信息系统培训中心）、甘肃经济信息网、省信息协会秘书处、甘肃省宏观经济学会秘书处等分支机构
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