中华农业文明博物馆建筑布局基本陈列由六个部分组成：第一部分介绍中华农业文明的起源；第二部分展示传统农业技术体系的创立与发展；第三部分为中国农业制度的历史演变；第四部分为中国传统农业在世界农业发展中的地位和影响；第五部分为丰富多彩的乡村生活与农业文化；第六部分为南京农业大学校史陈列，以实物、图片和文字展示南农人传承薪火、继往开来的奋斗精神
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