中国煤炭经济研究会组织体系实行理事会负责制
现任理事会为第八届理事会，由161名理事组成，其中常务理事53名，领导机构成员18名
内设五个业务处室
分别为综合（财务）处、会员处、战略发展处、政策研究处、信息处
下设四个分支机构
分别为审计分会、会计分会、煤炭规划与政策专业委员会、信息咨询中心
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