马余刚荣誉表彰时间荣誉表彰授予单位1994年上海市“十大杰出青年”1997年上海市科技精英1999年中国科学院青年科学家奖（二等奖）中国科学院2004年上海市优秀专业技术人员2005年第五届上海市自然科学牡丹奖 2006年第九届中国青年科技奖中央组织部、人事部、中国科协2006年上海市科教党委系统“优秀共产党员”2006年上海应用物理研究所“优秀共产党员”中国科学院上海应用物理研究所 2008年上海应用物理研究所“优秀共产党员”中国科学院上海应用物理研究所 2010年2007—2009年上海市先进工作者2011年上海市领军人才2011年6月中国科学院上海分院优秀共产党员中国科学院上海分院 2015年亚洲成就奖（Achievement in Asia Award）国际华人物理与天文学会 2017年中国科学院院士中华人民共和国国务院 国务院政府特殊津贴中华人民共和国国务院
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