在经过详细调查之后，台北市工务局指出，钱穆所居住的房舍系向台北市政府借用，依照规定，此项借用完全合法，钱穆可使用此住宅至1992年1月24日，“素书楼风波”因此才暂告一段落

 同年11月，钱穆患有重病，两个月不能起床不能正常饮食

钱穆任教于清华大学的长女钱易，当时正以访问学者的身份在荷兰从事研究工作，便申请赴台

次月，钱易却因“人大代表”身份及早年加入“共青团”的事，被指涉嫌参与叛乱组织，台湾最高法院甚至为此发出了传票，着令钱易依期出庭应讯

钱穆本着“君子不立危墙”的古训，让钱易在接到传票之前，提前两天乘飞机离开了台北

  1989年8月，“总统府资政”高玉树应邀在民进党临时大会上致词时，为其居所纠纷大发牢骚，并在接受记者采访时不满地指出：同样是“总统府资政”，何以钱穆被当成国宝，而他却被扫地出门？此一番话，在刚刚平静下来的素书楼里又掀起了一阵波澜

对于高玉树的指责，钱穆除去信《中国时报》澄清之外，还另函“总统府”，表明了将提前迁出的意愿

 1990年5月，台湾政界再起争斗，台北市“议会”的一些“议员”抨击素书楼为“非法修建”，要“限期收回”

其实素书楼是由台湾“总统府”向台北市当局借用，并由“行政院”核可，接租约规定，到1991年才期满，而且注明在期满后有权利可以续约再住下去

为了避免“享受特权”的误解，1990年6月1日，钱穆毅然搬出居住了二十多年之久的素书楼，迁入台北市区杭州南路自置寓所

 8月30日上午9点15分，钱穆在台北杭州南路寓所里无疾而终，享年96岁

 1992年1月，胡美琦将钱穆骨灰归葬于太湖西山的俞家渡石皮山

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