陈孚恩事迹咸丰元年（1851），奉命在家乡帮办团练

三年六月，太平军围攻南昌，陈孚恩协助江西巡抚张芾、湖北按察使江忠源固守南昌有功，获赐花翎奖励

八年，以头品顶戴代理兵部侍郎、礼部尚书、兵部尚书

十月，参与查勘顺天乡试舞弊案，内涉其子陈景彦，议降一级以示惩戒

九年，署刑部、户部尚书

十年九月，任吏部尚书

咸丰十一年（1861）七月，穆宗继位，陈孚恩被重新起用后，为巩固地位，他与载垣等亲近起来

后载垣等因力阻慈安、慈禧皇太后垂帘听政，被赐自尽，肃顺被斩

陈孚恩也因少詹事许彭寿以载垣党援所劾，又在搜查肃顺家时，得陈孚恩“暗昧不明语”私书，被捕入狱，籍没其家，追缴回宣宗所赠匾额，发配新疆戍边效力

同治三年（1864）六月，沙俄乘新疆回民反清举事之机，派兵侵占了伊犁西北的博罗湖吉尔卡伦

伊犁将军常清带领军民进行抗击，陈孚恩奋勉效力，常清为其请功，未准

四年春，新任伊犁将军明绪，奏言陈孚恩筹饷筹兵不遗余力，恳请予以释放，获准

并命陈孚恩留在伊犁，协助办理兵饷事宜

五年五月，新疆一支回民部队首领金相印，借助浩罕汗国（今乌兹别克）军队支援，攻陷伊犁

明绪等战死，陈孚恩及其亲人一同殉难

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