张启发科研成就科研综述张启发系统分析了世界大麦遗传多样性，揭示了世界大麦遗传变异的一些重要特点，阐述了世界栽培大麦东、西方独立起源的观点

应用分子标记系统分析了水稻杂种优势与分子标记杂合度的关系，剖析了杂种优势的遗传基础，揭示出大量的上位性遗传效应，提出了上位性是杂种优势的重要遗传基础的学术观点

制作了高密度分子标记连锁图，定位了20余个水稻重要主效基因和大量数量性状基因

应用分子技术培育出抗白叶枯病的优良杂交稻恢复系、米质改良的不育系及延缓叶片衰老、产量潜力显著提高的转基因水稻 

项目承担截至2017年，张启发先后承担了国家重点基础研究发展规划“973”项目，中国科学院学部咨询项目等研课题50余项

时间项目名称2021.12功能基因组与水稻遗传改良2017.07水稻体系功能基因组应用岗位科学家2016.07三系水稻杂种优势组学特征和调控网络2016.07水稻抗逆性状功能基因组研究2016.07水稻抗逆性状功能基因组研究—22016.03为亚洲和非洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻（三期）2016.01长链非编码RNA对水稻光敏感雄性不育的调控2015.01全基因组选择育种技术引进C2015.01水稻等主要农作物功能基因组研究发展态势分析2014.01以水稻为模式揭示杂种优势的功能基因组基础2013.01为非洲和亚洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻（二期，子合同）2012.01水稻S5杂种不育和广亲和的遗传与分子机理研究2010.01关注转基因植物与食品安全2010.01基因组研究与水稻遗传改良2009.01为非洲和亚洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻（参加）2008.01绿色超级稻相关水稻基因功能的鉴定2007.01基因组研究与水稻遗传改良2007.01稻种基因资源的功能鉴定及利用研究2004.01水稻抗旱研究:抗旱遗传和标记辅助选择成果奖励截至2017年，先后获得湖北省自然科学一等奖5项，国家自然科学二等奖2项

时间项目名称奖励名称2002、2003、2007、2011、2015湖北省自然科学一等奖2013水稻质量抗性和数量抗性的基因基础与调控机理国家自然科学二等奖 2016水稻产量性状的遗传与分子生物学基础国家自然科学二等奖 学术论著截至2018年2月，张启发出版中英文著作3部，在Proceedings of National Academy of Sciences、中国科学发表论文200多篇

主编书籍出版日期名称作者出版社2018.02《绿色超级稻的构想与实践》张启发著北京：科学出版社2015.02《资源节约型、环境友好型农业生产体系的理论与实践》张启发主编北京：科学出版社2013Genetics and Genomics of Rice. Plant Geneticsand Genomics: Crops and ModelsZhang Q, Wing RSpringer2009.12《绿色超级稻的构想与实践》张启发主编北京：科学出版社代表论文时间作者论文名称期刊信息2016Zhang J, Chen LL, Zhang Q*, et al.Extensive sequence divergence between the reference genomes of two elite indica rice varieties Zhenshan 97 and Minghui 63Proc Natl Acad Sci USA 113:E5163—712015Wang L, Sun S, Zhang Q*, et al.Coordinated regulation of vegetative and reproductive branching in riceProc Natl Acad Sci USA 112:15504—155092015Wang J, Yao W, Zhu D, Xie W, Zhang Q*Genetic basis of sRNA quantitative variation analyzed using an experimental population derived from an elite rice hybridElife 4:e039132014Xu S, Zhu D, Zhang Q*Predicting hybrid performance in rice using genomic best linear unbiased predictionProc Natl Acad Sci USA 111:12456—124612014Yu H, Xie W, Li J, Zhou F*, Zhang Q*A whole genome SNP array (RICE6K) for genomic breeding in ricePlant Biotechnol J 12:28—372013Gong L, Chen W, Gao Y, Liu X, Zhang H, Xu C, Yu S, Zhang Q*, Luo J*Genetic analysis of the metabolome exemplified using a rice populationProc Natl Acad Sci USA 110:20320—203252013Ouyang Y, Zhang Q*Understanding reproductive isolation based on the rice modelAnnu Rev Plant Biol 64:111—1352012Zhou G, Chen Y, Yao W, Zhang C, Xie W, Hua J, Xing Y, Xiao J, Zhang Q*Genetic composition of yield heterosis in an elite rice hybridProc Natl Acad Sci USA 15847—158522012Yang J, Zhao X, Zhang Q*, et al.A killer—protector system regulates both hybrid sterility and segregation distortion in riceScience 337:1336—13402012Ding J, Lu Q, Ouyang Y, Mao H, Zhang P, Yao J, Xu C, Li X, Xiao J, Zhang Q*A long noncoding RNA regulates photoperiod—sensitive male sterility, an essential component of hybrid riceProc Natl Acad Sci USA 109:2654—26592011Li Y, Fan C, Xing Y, Jiang Y, Luo L, Sun L, Shao D, Xu C, Li X, Xiao J, He Y, Zhang Q*Natural variation in GS5 plays an important role in regulating grain size and yield in riceNat Genet 43:1266—1269注：*表示通讯作者专利成果截至2017年，张启发申请中国国家发明专利30多项，参与培育了一批水稻优良新品种，其中3个获植物新品种权、7个通过国家和省级品种审定 

时间专利名称2010102230673水稻OsAPI5基因在育性控制中的应用2010102342062一种调控水稻株型的方法2010101884586一种控制水稻谷粒粒宽和粒重的主效基因GS5的克隆与应用2010105350592一种控制水稻株型，器官大小，根系及结实率性状的XIAO基因的克隆与应用2009101488666水稻粳型杂种育性基因S5—j的分离克隆及应用2009100623622水稻OsRPA1a基因在育性控制中的应用2009100620465控制水稻纤维素合成的基因BC1L4作为水稻遗传改良的应用2008101970300基因EcAAT在控制水稻谷粒品质中的用途2008100469894一个控制水稻成花转换及抽穗期基因RID1的克隆及应用2007100531994一种控制水稻谷粒产量、抽穗期和株高的多效性基因Ghd7的克隆及应用2009101488670水稻籼型杂种育性基因S5—i的分离克隆及应用2007100535529水稻广亲和基因S5的分离克隆及应用2006100185766一种水稻冷害基因及应用2006100185751一种控制水稻花粉育性基因及应用2006100185484一种鉴定白化苗基因型愈伤的方法2006100185450控制水稻分蘖的基因及用途2006100181074一种控制水稻谷粒粒长和粒重的主效基因GS3及其应用2006100181040一种控制水稻抽穗期基因及其应用2006100181055水稻木质素合成基因FC1及应用2005100199957一个被二化螟取食特异诱导表达的的水稻启动子及应用2005100198136一种调控水稻赤霉素合成的转录因子基因OsHOX4及其应用2005100198140一种调控水稻赤霉素合成的转录因子基因OsYAB1及其应用2006101417027一种适用于籼稻离体培养的分化培养基2004100133457一种籼稻的离体培养方法2004100133442利用农杆菌介导的培育籼稻转基因植株的方法

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