刘兴洲工作业绩在中国医学科学院北京协和医院、卫生部中日友好医院工作期间，主持并开展了大量科研工作，其中包括：国家自然科学基金项目、卫生部项目、中国医学科学院北京协和医院研究项目、国家十五攻关项目等
曾担任卫生部全国重点学科项目负责人，获得国家科技进步二等奖，卫生部科技进步一等奖，美国科尔比科学与文化信息中心科学成就奖，并于2003年被卫生部选派参加国家四部委（人事部、科技部、教育部、中宣部）
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