生物技术工业与环境生物技术应用于工业制造和环境管理，是为了推动工业的可持续发展，1998年，经济合作与发展组织认为生物技术将对工业的持续发展起着十分关键的作用，鼓励其成员国支持工业和环境生物技术的研究
微生物被认为是天然的化学工厂
它们正取代工业催化剂而用于化学品的制造
例如，酶制剂能取代洗涤剂中的磷和皮革鞣制过程中的硫化物
在造纸过程中，酶制剂可以减少氯化物在纸浆漂白过程中的用量
微生物在工业生产过程中的应用，使工业生产变得清洁、高效，具有可持续性
酶也可以作为生物催化剂将生物质转化为能源、乙醇等
更诱人的是，通过生物酶，玉米秸秆可以转化为可降解的塑料，用于食品包装等
基因学和蛋白质学在工业生物技术中的应用，不仅仅在于发现微生物酶的特性，而且可以通过目标的变异，使微生物产生各种用途的新型酶制剂
科学家预测10至20年后，生物技术在工业中的应用将与其在人类健康中的应用变得同等重要
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