桂林市中山中学办学历史学校前身是由李宗仁、白崇禧，黄旭初等人筹建的“广西省立实验国民基础学校”
民国26年5月（1937年5月），由李宗仁、白崇禧倡议，广西省政府于江南会馆钵园开办广西中山纪念学校，首任校长为尚仲衣
同年8月，迁王辅坪体育场（现滨江校区）新建校舍上课 ，同年，于王辅坪中山纪念学校内成立中山纪念学校幼稚园
民国27年（1938年），改名为“中山纪念学校”
同年，教育家陶行知在桂林创建生活教育总社并任社长（社址在中山中学内），在并社内了做了“生活即教育”的著名演讲
民国28年（1939年），开办初中班
民国32年（1943年），开设高中班， 并改名为桂林市私立中山中学
1950年2月， 经桂林市人民政府批准，私立中山中学停办
1966年底，改为“桂林市第九中学”
1985年，在孙中山先生诞辰纪念日，学校正式恢复“桂林市中山中学”这一校名
2012年7月，获准成为广西壮族自治区示范性高中立项建设学校
2015年学校初中部剥离
学校获批准为广西壮族自治区示范性普通高中
2016年4月，原建设清风校区改为建设城北校区
2018年4月，桂林市中山中学城北校区开工建设
2018年9月，学校初中部恢复办学，暂位于滨江校区
2019年9月，中山中学城北校区启用
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