甲状腺炎病因自身免疫、病毒感染、细菌感染、真菌感染、慢性硬化、放射损伤、肉芽肿、药物、创伤等多种原因均与甲状腺炎的发病有关
葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌等细菌感染，可引起急性甲状腺炎
甲状腺病毒感染如柯萨奇病毒、腮腺炎病毒、流感病毒、腺病毒感染，被认为是亚急性甲状腺炎的发病原因，也可发生于非病毒感染（如Q热或疟疾等）之后
此外遗传易感性和环境等因素也与自身免疫性甲状腺的发病相关
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