宁德世界地质公园水文白水洋园区内溪流密布，沟壑纵横，分布较为均匀
下村、潭头、岩后、后峭、宜洋、郑山、西岩、考溪、前洋等地各有一条小溪汇入鸳鸯溪
鸳鸯溪全长18千米，流程长，落差高达300多米
白云山园区内水系发达，蟾溪、竹洲、墙坪等地各有一条小溪汇入穆阳溪
穆阳溪总长116千米，流域面积1 389平方千米
穆阳溪发源于政和镇前，流经周宁荷洋及福安境内社口、穆阳、康厝、溪潭、至赛岐镇廉首村前汇入富春溪，汇合后称赛江
交溪源于鹫峰山脉、洞宫山脉和太姥山脉，流域总面积5 638平方千米，主干支流总长433千米，是福建省第三大河流
园区内现有黄兰湖、九龙湖、金蟾湖等水库
太姥山园区内水系为短小水系，直流入海
较大的水系为流经公园西南部的杨家溪（又称九鲤溪、赤溪），发源于邻县（柘荣县），由西向东流入区内，后转向南，经霞浦牙城入海
福鼎市内流域面积250平方千米，主溪流长23.3千米
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