蛋白质数据库性能及历史蛋白质数据库(HPDB),建于2005年5月, 动态展示生物大分子立体结构,鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离,可用于教学或科研
服务对象是能够熟练使用中文的生命科学、医学、药学、农学、林学等领域的大中专学生、教师及科技工作者
分子结构特征描述采用汉语,同时提供英文原文以供考证
对于善于使用英文的读者,我们提倡直接访问RCSB PDB,一来可以减少网络拥挤,二来可以减少由于 HPDB 的翻译不妥带来的不便
蛋白质数据库(HPDB)对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译(最新加入数据库的分子除外),内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等
这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库, 因此 HPDB 支持中文查询
蛋白质数据库(HPDB)虽然翻译了“分子结构说明”部分,但为了保证数据的可靠性和准确性,HPDB对一级结构序列及大分子结构坐标数据等未做任何改动,数据库保持 RCSB PDB 核实后的原始实验数据文件,并保持 PDB 文件格式和蛋白质分子编号
布鲁克海文蛋白质数据库(TheBrookHavenProteinDataBank,PDB)是由美国布鲁克海文国家实验室所维护的关于生物大分子三维结构的数据档案,其内容包括生物大分子的原子坐标、参考文献、1级和2级结构信息,也包括了晶体结构因数以及NMR实验数据
PDB由美国国家科学基金等组织提供资助,对全球的科研工作者、教育工作者以及学生等提供免费服务
PDB创立于1973年,到了90年代,PDB中的数据开始逐步发展丰富起来
据统计,从1992—1996年该库收集的生物大分子结构的数目分别是1007、1727、2921、3821和4707,平均每年递增50%
到1998年4月8日为止,该库共收集了7429个原子坐标的入口文件,1739个结构因数文件,429个NMR抑制文件
PDB中主要收集蛋白质的结构信息,也包括了少量的核酸及糖的三维结构
获得信息的实验技术主要为X线衍射技术以及NMR实验技术
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