首都医科大学科研平台截至2022年6月，学校有3个国家医学中心、6个国家临床医学研究中心；2个省部共建协同创新中心，2个北京高精尖创新中心；1个省部共建国家重点实验室培育基地、5个教育部重点实验室、1个工信部实验室、1个国家药监局实验室、3个北京实验室、54个北京市重点实验室；1个国家工程研究中心、1个国家工程技术研究中心、3个教育部工程研究中心、10个北京市工程技术研究中心；有3个教育部创新团队，3个科技部重点领域优秀创新团队
平台类型平台名称国家工程实验室互联网医疗救治技术及应用国家工程实验室国家工程技术研究中心国家眼科诊断与治疗设备工程技术研究中心省部共建国家重点实验室培育基地北京市脑重大疾病重点实验室—国家重点实验室培育基地省部共建协同创新中心脑重大疾病防治省部共建协同创新中心 教育部重点实验室神经变性病教育部重点实验室、耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室、儿科重大疾病研究教育部重点实验室教育部工程研究中心医疗信息化技术教育部工程研究中心（脑血管病分中心）、眼科诊疗设备与材料教育部工程研究中心、心血管诊疗技术与器械教育部工程研究中心、内源式预防药物教育部工程研究中心教育部创新团队大血管疾病转化医学研究、鼻病基础和临床研究 、帕金森病的基础与临床研究 科技部重点领域创新团队脑血管病防治研究创新团队、心律失常的临床研究和治疗器械研发创新团队、出血性脑血管病血管内治疗研究创新团队 北京市重点实验室多肽及小分子药物北京市重点实验室、眼科学与视觉科学北京市重点实验室、临床流行病学北京市重点实验室、脑功能疾病调控治疗北京市重点实验室、热带病防治研究北京市重点实验室、消化疾病癌前病变北京市重点实验室、全牙再生与口腔组织功能重建北京市重点实验室、乙型肝炎与肝癌转化医学研究北京市重点实验室、艾滋病研究北京市重点实验室、中枢神经系统损伤研究北京市重点实验室、磁共振成像脑信息学北京市重点实验室、帕金森病研究北京市重点实验室、癫痫病临床医学研究北京市重点实验室、精神疾病诊断与治疗北京市重点实验室、新发突发传染病研究北京市重点实验室、耐药结核病研究北京市重点实验室、儿童血液病与肿瘤分子分型北京市重点实验室、糖尿病研究防治北京市重点实验室、老年认知障碍疾病北京市重点实验室、脑肿瘤研究北京市重点实验室、儿童耳鼻咽喉头颈外科疾病北京市重点实验室、高血压病研究北京市重点实验室、环境毒理学北京市重点实验室、临床生物力学应用基础研究北京市重点实验室、肿瘤治疗性疫苗北京市重点实验室、神经再生修复研究北京市重点实验室、肝脏保护与再生调节北京市重点实验室、肿瘤侵袭和转移机制研究北京市重点实验室、头颈部分子病理诊断北京市重点实验室、胎儿心脏病母胎医学研究北京市重点实验室、儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室、低氧适应转化医学北京市重点实验室、移植耐受与器官保护北京市重点实验室、中医络病研究北京市重点实验室、神经电刺激研究与治疗北京市重点实验室、中医感染性疾病基础研究北京市重点实验室、儿童慢性肾脏病与血液净化北京市重点实验室、眼内肿瘤诊治研究北京市重点实验室、心肺脑复苏北京市重点实验室、传染病相关疾病生物标志物北京市重点实验室、银屑病中医临床基础研究北京市重点实验室、尿液细胞分子诊断北京市重点实验室、上气道功能障碍相关心血管疾病研究北京市重点实验室、脑可塑性与脑功能重建新技术北京市重点实验室、针灸神经调控北京市重点实验室、临床合理用药生物特征谱学评价北京市重点实验室、肝衰竭与人工肝治疗研究北京市重点实验室、遗传性出生缺陷精准医学研究北京市重点实验室、冠心病精准治疗北京市重点实验室北京市工程技术研究中心北京市神经药物工程技术研究中心、北京市人工听觉工程技术研究中心、北京市心脑血管医疗技术与器械工程技术研究中心、北京市免疫试剂临床工程技术研究中心、北京市儿童外科矫形器具工程技术研究中心、北京市大血管外科植入式人工材料工程技术研究中心、北京市神经系统3D打印临床医学转化工程技术研究中心、北京市神经介入工程技术研究中心、北京市肝炎与肝癌精准医疗及转化工程技术研究中心北京市高等学校工程研究中心北京市耳鼻咽喉头颈科学高等学校工程研究中心北京市哲学社会科学研究基地首都卫生管理与政策研究基地北京市科研院所北京脑重大疾病研究院（校本部）、北京市老年病医疗研究中心（宣武医院）、北京市眼科研究所（同仁医院）、北京市耳鼻咽喉科研究所（同仁医院）、北京市呼吸疾病研究所（朝阳医院）、北京热带医学研究所（友谊医院）、北京市临床医学研究所（友谊医院）、北京市儿科研究所（儿童医院）、北京市神经外科研究所（天坛医院）、北京市心肺血管疾病研究所（安贞医院）、北京口腔医学研究所（口腔医院）、北京市中医研究所（中医医院）校级研究所首都医科大学基础医学研究所（基础医学院）、首都医科大学疼痛生物医学研究所（基础医学院）、首都医科大学低氧医学研究所（基础医学院）、首都医科大学脑功能影像研究中心（基础医学院）、首都医科大学心血管病转化医学研究中心（基础医学院）、首都医科大学心血管研究所（基础医学院）、首都医科大学肿瘤研究所（基础医学院）、首都医科大学医学实验动物研究所（基础医学院）、首都医科大学公共卫生与预防医学研究所（公卫学院）、首都医科大学循证医学中心（公卫学院）、首都医科大学药物研究所（药学院）、首都医科大学生物医学工程研究所（生工学院）、首都医科大学生物力学研究中心（生工学院）、首都医科大学生物信息学研究中心（生工学院）、首都医科大学中医药研究所（中医药学院） 临床诊疗与研究中心眩晕临床诊疗与研究中心宫腔粘连疾病临床诊疗与研究中心急性胰腺炎临床诊疗与研究中心呼吸系感染临床诊疗与研究中心眼部肿瘤临床诊疗与研究中心下肢动脉硬化闭塞症临床诊疗与研究中心儿童血液肿瘤临床诊疗与研究中心儿童肝脏移植临床诊疗与研究中心结直肠肿瘤临床诊疗与研究中心主动脉疾病临床诊疗与研究中心中枢神经系统运动障碍性疾病临床诊疗与研究中心耳鸣临床诊疗与研究中心儿童上气道阻塞性疾病临床诊疗与研究中心冠心病临床诊疗与研究中心抑郁症临床诊疗与研究中心视网膜血管性疾病临床诊疗与研究中心口腔颅颌面畸形临床诊疗与研究中心慢性鼻炎和鼻窦炎临床诊疗与研究中心帕金森病临床诊疗与研究中心神经变性病与记忆障碍疾病临床诊疗与研究中心青光眼临床诊疗与研究中心结核病临床诊疗与研究中心间质性肺疾病临床诊疗与研究中心垂体腺瘤临床诊疗与研究中心脑胶质瘤临床诊疗与研究中心少见、罕见肝病临床诊疗与研究中心艾滋病临床诊疗与研究中心（地坛医院）艾滋病临床诊疗与研究中心（佑安医院）消化道早期癌临床诊疗与研究中心心脑联合病变临床诊疗与研究中心脑血管病临床诊疗与研究中心心律失常临床诊疗与研究中心OSAHS临床诊疗与研究中心----------
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