南开大学科研机构截至2020年12月，学校有国家重点实验室2个，国家工程研究中心1个，国家地方联合工程研究中心1个，2011协同创新中心3个
教育部重点实验室7个，教育部工程研究中心3个，教育部国际合作联合实验室2个，国家环境保护重点实验室1个，国家人权教育与培训基地1个，教育部人文社会科学重点研究基地6个，省部共建协同创新中心1个，教育部国别和区域研究基地7个（培育基地1个、备案基地6个），示范性国家国际科技合作基地4个
天津市重点实验室20个，天津市工程技术中心4个，天津市国际科技合作基地22个，天津市人文社科重点研究基地9个，天津市高校智库8个，天津市社科实验室5个，天津市爱国主义教育基地1个，1个研究机构入选中国智库综合评价核心智库榜单专业性智库（经济领域高校A类智库），6个研究机构入选首批“中国智库索引”（CTTI）来源智库，3个研究机构入选天津市高校智库
科研平台名称类别国家重点实验室元素有机化学国家重点实验室药物化学生物学国家重点实验室国家工程研究中心农药国家工程研究中心教育部重点实验室先进能源材料化学教育部重点实验室分子微生物学与技术教育部重点实验室生物活性材料研究教育部重点实验室功能高分子材料教育部重点实验室核心数学与组合数学教育部重点实验室弱光非线性光子学教育部重点实验室环境污染过程与基准教育部重点实验室光电信息技术科学教育部重点实验室国家数学中心陈省身数学研究所2011计划天津化学化工协同创新中心（与天津大学化工学院合建）生物治疗协同创新中心中国特色社会主义经济建设协同创新中心（联合组建）教育部人文社会科学重点研究基地南开大学公司治理研究中心跨国公司研究中心中国社会史研究中心南开大学人权研究中心政治经济学研究中心APEC研究中心世界近现代史研究中心高等学校学科创新引智基地（“111计划”）功能有机分子构成与构效关系研究创新引智基地弱光非线性光子学科学与技术创新引智基地功能蛋白质科学创新引智基地先进能源材料化学创新引智基地新型污染物环境过程与风险评估创新引智基地 重大疾病发病机制及治疗策略创新引智基地无机固体材料与能源化学学科创新引智基地 新一代太阳光伏发电技术伏光创新引智基地教育部工程研究中心薄膜光电子技术教育部工程研究中心微生物功能基因组与检测技术教育部工程研究中心高效储能教育部工程研究中心部委实验室环保部国家环境保护城市空气颗粒物污染防治重点实验室 教育部国际合作联合实验室生物医学国际合作联合实验室 新能源材料化学国际合作联合实验室基金委创新研究群体“功能有机分子的构筑与构效关系”创新研究群体“微分几何”创新研究群体“杂原子有机化学”创新研究群体教育部2013年度“创新团队发展计划”入选团队“光子学及其技术”（许京军）“新能源材料化学基础及应用研究”（陈军）“组合数学”（李学良）国家国际科技合作基地新型光伏发电技术国际科技合作基地肿瘤免疫与生物疫苗国际科技合作基地光学与光子学国际科技合作基地“中国智库索引”（CTTI）来源智库南开大学滨海开发研究院南开大学当代中国问题研究院南开大学经济与社会发展研究院南开大学亚太经济合作组织研究中心南开大学政治经济学研究中心中国特色社会主义经济建设协同创新中心中国智库综合评价核心智库南开大学经济与社会发展研究院天津市高校智库南开大学当代中国问题研究院南开大学滨海开发研究院南开大学经济与社会发展研究院南开大学老龄社会治理战略研究中心 天津市重点实验室天津市信息光子材料与技术重点实验室天津市光电子薄膜器件与技术重点实验室天津市金属与分子基材料化学重点实验室天津市蛋白质科学重点实验室天津市生物活性材料研究重点实验室天津市分子药物研究重点实验室天津市智能机器人技术重点实验室天津市微生物功能基因组学重点实验室天津市能源材料化学重点实验室天津市光电传感器与传感网络技术重点实验室 天津市城市生态环境修复与污染防治重点实验室天津市肿瘤微环境和神经血管调节重点实验室天津市生物传感与分子识别重点实验室天津市食品科学与健康重点实验室 天津市工程中心天津市城市环境污染诊断与修复技术工程中心 天津市钢铁冶金及制品清洁技术工程中心 天津市生物质类固废资源化技术工程中心天津市生物质类固废资源化技术工程中心天津市国际科技合作基地南开大学中-日电子废弃物资源化国际联合研究中心肿瘤免疫药物国际联合研究中心功能高分子国际联合研究中心土壤环境国际联合研究中心功能蛋白质生物国际联合研究中心新能源材料国际联合研究中心新材料与清洁能源国际联合研究中心机器人与自动化国际联合研究中心病原菌生物学国际联合研究中心环境修复与可持续发展国际联合研究中心新型污染物暴露组学国际联合研究中心中加水与环境安全联合研发中心先进水处理技术国际联合研究中心生物质固废资源化国际联合研究中心太阳能光伏发电技术国际联合研究中心城市交通污染防治国际联合研究中心恶性肿瘤发病机理与治疗策略国际联合研究中心天津市技术转移示范机构南开大学科技成果转化中心 资料来源：
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