博尔塔拉职业技术学院教学机构继续教育负责成人继续教育、远程教育（函授教育）和各类职业技能培训、安全生产培训等工作；负责实施规定工种、层次的职业技能鉴定及考评员队伍建设等工作

 思政部负责全院学生的思想政治课、德育活动课、就业指导课程的教学、公共文化课和思想政治科研等工作

 双语教学部负责全院民语言学生预科阶段的教学管理、课程建设和师资队伍建设等工作；负责本部教师思想政治教育和日常管理工作；负责本部学生日常管理工作；负责组织学生参加中国少数民族汉语水平（MHK）等级考试

 医药卫生系负责护理等医疗卫生类专业建设、课程改革、师资队伍建设、实训基地建设以及教学、科研、实习实训工作；负责本系教师思想政治教育和日常管理工作；负责本系学生日常管理工作；负责本系所属专业招生就业工作

 教育系负责学前教育等教育类专业建设、课程改革、师资队伍建设、实训基地建设以及教学、科研、实习实训工作；负责本系教师思想政治教育和日常管理工作；负责本系学生日常管理工作；负责本系所属专业招生就业工作

 汽车系负责汽车检测与维修技术等汽车类专业建设、课程改革、师资队伍建设、实训基地建设以及教学、科研、实习实训工作；负责本系教师思想政治教育和日常管理工作；负责本系学生日常管理工作；负责本系所属专业招生就业工作

 机电系负责电气自动化技术等机电类专业建设、课程改革、师资队伍建设、实训基地建设以及教学、科研、实习实训工作；负责本系教师思想政治教育和日常管理工作；负责本系学生日常管理工作；负责本系所属专业招生就业工作

 旅游与经济管理系负责旅游管理、会计、物流管理等旅游类和经济管理类专业建设、课程改革、师资队伍建设、实训基地建设以及教学、科研、实习实训工作；负责本系教师思想政治教育和日常管理工作；负责本系学生日常管理工作；负责本系所属专业招生就业工作

 电子信息系负责电子商务技术、移动商务等电子信息类专业建设、课程改革、师资队伍建设、实训基地建设以及教学、科研、实习实训工作；负责本系教师思想政治教育和日常管理工作；负责本系学生日常管理工作；负责本系所属专业招生就业工作

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