安徽中医药大学安徽中医学院1959年，安徽省政府正式批准成立安徽中医学院，郭沫若先生题写校名
1970年，安徽中医学院并入安徽医学院
1975年，国家教育部批准恢复安徽中医学院
1978年，开始招收硕士研究生
1981年，经国务院批准，学校成为全国首批硕士学位授予单位
1999年，开始联合培养博士研究生
2000年，安徽省医药学校并入安徽中医学院
2005年，通过国家教育部本科教学工作水平评估
2008年，获得开展硕士研究生推荐免试资格
2009年，学校通过国家教育部中医学专业试点认证
同年，被批准为国家级新增博士学位授权立项建设单位
2011年，安徽省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院
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