安徽中医药大学校徽校徽以“悬壶济世”典故为切入点，以安徽地域特色的徽派建筑（马头墙）为形，辅以太极、蛇杖、中草药构筑成一个完整的“中”字，表达中医治病救人的仁德
药葫芦代表以中医济世著称的“北华佗”医学流派，徽派建筑则代表“南新安”的新安医学，两个医学文化在安徽中医药大学交融，得到传承
标志中间部分似手掌形，代表中医的把脉
在徽派建筑（马头墙）框架里，药葫芦内含乾坤太极，又融合了世界常用的蛇杖医学标志，杖也可以理解为针灸之银针，表明在继承和发扬中医传统精华的同时，更有积极开放的胸襟和创新的精神
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