杭州医学院教学建设质量工程据2021年10月学院网站信息显示，杭州医学院拥有国家级一流专业建设点2个(本科)、中央财政支持专业建设项目2个（专科）、国家首批“卓越医生教育培养计划”试点项目1个（专科）、省级一流专业建设点5个（本科）、省级十三五特色专业2个（本科），省级特色专业7个（专科）
国家级一流本科专业建设点：医学检验技术 、药学 中央财政支持的重点建设专业（高职高专）：药学、医学检验技术 省级重点专业（高职高专）：医学影像技术 省级特色专业（高职高专）：临床医学、药学、医学检验技术、护理、医学影像技术 省级优势专业（高职高专）：临床医学、药学 中央财政支持实训基地（高职高专）：临床技能实训基地、护理技能实践基地、医学影像实训中心 省级示范性实训基地（高职高专）：医学形态实训基地、药学综合实训基地、基层公共卫生实训基地 国家级精品课程（高职高专）：药理学 国家级精品资源共享课程（高职高专）：药理学 省级精品课程（高职高专）：内科学、药理学、病理学与病理生理学、药物化学、药物分析、实用生物化学、药学微生物及技术、天然药物学实用技术、临床实用生理学、卫生法规与监督实务、内科护理学 国家级教学成果二等奖：《乡村医生连续统一体培养模式的探索与实践》教学研究项目（2005年）附属医院截至2018年5月，杭州医学院共有三级甲等直属附属医院1家，非直属附属医院5家，教学医院61家，教学基地74个
三级甲等直属附属医院：浙江省人民医院杭州医学院-西门
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