宁波工程学院研究中心浙江省“2011协同创新中心”：智慧交通与大数据协同创新中心
浙江省新型高校智库：现代物流研究中心
浙江省高校高水平创新团队：第三代半导体低维材料与器件
另外，还建有外国语言文学研究所、传统文化传播研究所、城市治理研究中心、社会治理协同创新中心、混凝土结构耐久性研究所、 BIM(建筑信息模型)研究中心、建筑节能研究所、产品设计研究所、财务与金融研究所等36个校内研究机构
研究中心名称备注工程教育研究中心/国际港口与物流研究中心 与宁波市人民政府与中国社会科学院合作现代物流研究中心/港口城市发展与环境研究中心与中国社会科学院合作可再生能源建筑应用能效测评研究中心可再生能源建筑应用能效测评的单位
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