南通大学杏林学院院系专业截止2022年10月，学院设有48个专业，涵盖经济学、文学、理学、工学、医学、管理学和艺术学等七大学科门类
院系专业学部学系专业名称人文思政与艺术体育部语言文学系汉语言文学、广播电视学、英语、日语艺术系视觉传达设计、艺术设计、产品设计、动画公共课教学系体育、思政、军事理论理学与管理学部理学系自然地理与资源环境、人文地理与城乡规划、酒店管理、海洋技术、应用心理学、数字媒体、应用统计学、经济统计学光电信息科学与工程经管系市场营销、会计学、国际经济与贸易、物流管理、行政管理城市管理工学部交通与土木系土木工程、工程管理、交通设备与工程机电系机械工程、自动化防化系纺织工程、服装设计与工程、服装与服饰设计、轻化工程化学工程与工艺信息科学系计算机科学与技术、软件工程、物联网工程、电子信息工程医学系医学系临床医学、医学影像技术、护理学、药学检验系医学检验技术
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