吉林铁道职业技术学院院系设置截至2021年10月，学校设有10个二级学院，设立马克思主义学院、公共教学部、体育部3个教学单位，开设42个专科专业

 专业设置系部专业铁道运输学院铁道交通运营管理、高速铁路客运乘务、铁路物流管理、空中乘务高铁综合技术学院铁道信号自动控制、铁道通信与信息化技术、铁道通信信号设备制造与维护、高铁综合维修技术、智能交通技术运用铁道工程学院铁道工程技术、高速铁道工程技术、铁路桥梁与隧道工程技术、道路桥梁工程技术、建筑工程技术铁道机车学院铁道机车、铁道机车车辆制造与维护东北亚高铁学院铁道车辆、动车组检修技术城市轨道交通学院城市轨道交通车辆技术、城市轨道交通机电技术、城市轨道交通通信信号技术、城市轨道交通供配电技术、城市轨道交通工程技术、城市轨道交通运营管理电气工程学院铁道供电技术、供用电技术、机电设备维修与管理、电气自动化技术机械工程学院汽车检测与维修技术、新能源汽车技术、汽车营销与服务、汽车制造与装配技术、铁道机械化维修技术、工程机械运用技术、焊接技术与自动化、机械制造与自动化管理学院会计、财务管理、旅游管理、数字媒体艺术设计乡村发展学院 ——

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