吉林医药学院科研成果截至2016年11月，学校立项国家重大科技专项1项、国家自然科学基金项目16项、省重大科技专项2项，省级项目181项；发表SCI收录70篇，重要期刊论文241篇；获省科技成果奖12项（自然科学奖、科学技术进步奖二等奖各1项），发明专利6项

2016年11月，该校蔡建辉教授主持的“冠状动脉粥样硬化新标记物与药物降脂机制研究”项目，获省自然科学奖二等奖；由温春阳教授主持的“Ang-1、Ang-2和Tie-2在大肠癌中的表达及其作用的分子机制研究”项目获省科学技术进步奖二等奖

 2016年11月，该校沈楠老师主持的《萱草花总黄酮抗肝损伤的实验研究》、邰志艳老师主持的《非奇异H矩阵的判定系列学术论文》荣获吉林市自然科学学术成果奖一等奖；欧仁侠老师主持的《基于高斯滤波的光学元件损伤图像在线检测》荣获吉林市自然科学学术成果奖二等奖；欧仁侠老师主持的《非线性移动通信系统的PSK控制盲信道调制算法》、张曾昱老师主持的《基于掌上虚拟社区的高校教师隐性知识交流平台实践研究》荣获吉林市自然科学学术成果奖三等奖

 2016年3月，该校杨敬研副教授撰写的论文《基于军游虚拟技术拓展高校国防教育的研究》获全国军事课科研论文成果一等奖

 2015年11月，该校马克思主义学院院长姜淑兰教授申报的“新的历史条件下如何理解中国工人阶级是国家的领导阶级”和傅伟韬副教授申报的“如何理性看待当今社会的道德问题”入选教育部人文社会科学研究专项

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