沈阳药科大学科研机构据学校2016年3月官网显示，学校是国家中成药工程技术中心、沈阳国家新药安全性评价研究中心的重要组成单位，为国家化合物库环渤海卫星库牵头单位

截止2016年4月，拥有国家级平台1个、国家教育部重点实验室1个、国家发改委国家地方联合工程实验室1个、国家中医药管理局科研实验室和研究室6个、省级重点实验室（工程技术研究中心）25个、省级创新平台1个、省级协同创新中心1个、省级大学科技园1个、市级重点实验室（工程技术研究中心）12个

 国家级国家级综合性新药研发平台：辽宁省国家重大新药创制综合平台国家地方联合工程实验室：中药质量控制技术国家地方联合工程实验室国家教育部重点实验室：基于靶点的药物设计与研究教育部重点实验室省部级 序号名 称负责人批准部门批准时间1中药质量分析实验室袁丹国家中医药管理局2003.7(2008年底重新换证评估）2中药药理实验室邹莉波国家中医药管理局2003.7(2008年底重新换证评估）3中药化学实验室宋少江国家中医药管理局2003.7(2008年底重新换证评估）4中药分析实验室于治国国家中医药管理局2003.7(2008年底重新换证评估）5中药制剂实验室陈大为国家中医药管理局2004.86情志病中医实验模型吴春福国家中医药管理局2009.57辽宁省中药质量控制技术工程实验室毕开顺辽宁省发展和改革委员会2008.78辽宁省新药安全评价技术重点实验室第二单位辽宁省科学技术厅2005.19辽宁省新药筛选重点实验室吴春福辽宁省科学技术厅2005.110辽宁省创新药物设计与评价重点实验室程卯生辽宁省科学技术厅2005.311辽宁省药物制剂工程技术研究中心何仲贵辽宁省科学技术厅2005.312辽宁省中药质量控制重点实验室毕开顺辽宁省科学技术厅2006.113辽宁省天然药物现代分离与工业化制备工程技术研究中心赵余庆辽宁省科学技术厅2006.814辽宁省药物代谢与药物动力学重点实验室邸 欣辽宁省科学技术厅2008.1215辽宁省新药药效评价重点实验室吴春福辽宁省科学技术厅2008.1216辽宁省现代药物制剂研究重点实验室王思玲辽宁省科学技术厅2009.1117辽宁省抗感染药物小分子合成重点实验室宫平辽宁省科学技术厅2009.1118辽宁省药用微生物应用工程技术研究中心张怡轩辽宁省科学技术厅2009.619辽宁省中药文化和中药标本科普基地贾景明辽宁省科学技术厅2009.1120辽宁省微生物制药重点实验室夏焕章辽宁省科学技术厅2010.821辽宁省东北道地药材资源研发重点实验室殷 军辽宁省科学技术厅2011.0822辽宁省植物多酚研究与开发工程技术研究中心吴春福辽宁省科学技术厅2011.0823辽宁省创新药物与临床转化工程技术研究中心吴春福辽宁省科学技术厅2012.624中药现代化工程技术研究中心毕开顺辽宁省教育厅2004.1225药物剂型设计与评价重点实验室王思玲辽宁省教育厅2004.326中药资源研究与开发重点实验室殷军辽宁省教育厅2007.827中药神经药理证治重点研究室吴春福辽宁省中医药管理局2010.328中药质量控制重点研究室毕开顺辽宁省中医药管理局2010.329中药化学重点研究室裴月湖辽宁省中医药管理局2010.3

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