南京市莫愁中等专业学校专业设置该校开设五年制高职（大专）和三年制中专两大办学层次，有药物制剂技术、药品质量检测技详情术、医用电子仪器与维护、计算机应用技术、动漫设计与制作、古籍修复、机电技术应用、电子与信息技术、电子商务、酒店服务与管理、电脑美术设计、连锁经营与管理等专业、现代服务系，其中“药剂”、“医用电子仪器与维护”、“电脑美术设计”专业是江苏省示范专业
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