麦克马斯特大学历史沿革早在1830年代，活跃于加拿大中部的浸信会教徒一直倡议办学
1887年，参议员威廉姆麦克马斯特（William McMaster）离世后将其遗产捐出，创办一所基督徒学府，而学校亦以其名字命名
校舍当时设在位于多伦多市的McMaster Hall， 1890年投入运作，教授文科及伦理学，并于1894年首次颁发学位
1930年，在汉密尔顿市民校友及安省魁省浸信会成员的捐助下，校舍迁移至安大略湖西岸的汉密尔顿市
校园早期建筑物包括University Hall，Edwards Hall，Wallingford Hall等
原本位于多伦多的校舍则变成现今的皇家音乐学院
战后，在前校长H.G. Thode的领导下，作为教会学校的麦马无论在科研方面及收生人数都有显著增长，但亦因此而面对着庞大的财政压力
1957年，麦马转变成一所非教会私立大学
而一直和学校保持着密切关系的浸信会则继续在校园内的神学院（Divinity College）教授伦理学，维持着学校一贯的宗教传统
11年后，根据麦马条例（1968-1969），除神学院维持现状外，学校其余部份则划分成文学部、理学部及医学部
1974年，经过一连串的改革和整合后，原本的部门陆续演变成今日的6个学院：人文学院、社科学院、理学院、工学院、医学院及商学院
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