安徽医科大学研究生学院培养管理在培养管理方面，逐步规范化、科学化，1997年以前一直是纸质化管理，1998年开始使用数据库技术，2002年开始建立研究生管理信息系统
在学位授予方面，为保证学位授予质量，在研究生后期培养过程中，重点加强了开题、中期检查等工作
在论文发表要求方面，2000年以前授予学位没有公开发表论文的要求，自2001年开始要求硕士研究生在申请学位前必须以安徽医科大学为第一作者单位在中国科技论文统计源期刊公开发表论文一篇、博士研究生在国家级核心期刊发表论文一篇
从2003年开始，研究生发表论文的要求进一步提高，硕士研究生要在相关专业国家级核心期刊以第一作者发表论文一篇、博士研究生要在相关专业SCI收录期刊以第一作者发表论文一篇
“十五”期间研究生的科学研究工作及其所发表的大量论文对安徽医科大学科学研究事业的发展起到了积极的推动作用，对实现安徽医科大学由教学型大学向教学研究型大学转变做出了巨大贡献
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