清华大学航空学院院校合作学院在航天航空方面注重与国内外的著名航空航天院校、研究所建立长期、良好的合作关系，在学院成立之前的2003年，清华大学就与中国一航签订在科研合作和人才培养方面的协议

同年，美国通用电气公司（GE）发动机公司在清华大学设立喷气推进联合研究中心

2005年，清华大学－沈阳飞机设计研究所联合研究中心成立

航天航空学院下设航空宇航工程系、工程力学系和航空技术研究中心，宇航技术研究中心保持跨学科特色，挂靠航天航空学院

航空宇航工程系下设5个研究所，分别为工程动力学研究所、飞行器设计研究所、推进与动力技术研究所、人机与环境工程研究所和空天信息技术研究所；工程力学系下设4个研究所，分别为固体力学研究所、流体力学研究所、工程热物理研究所和生物力学与医学工程研究所

2、专业设置与人才培养为国家培养高层次高水平的科技人才是学院的重要目标

自2003年起，校学术委员会同意工程力学系的本科生培养计划改为“工程力学与航天航空工程”，并在同年获得国务院学位委员会批准

学院现有约360名本科生，约380名研究生（180名博士生和200名硕士生），每年从国内外招收90名本科新生

2005年开设的航天员工程硕士研究生班，将为中国载人航天事业做出重要贡献

力学和热科学是现代科学技术中历史悠久、发展迅速，应用广泛的专业，具有技术科学类的特点，其专业知识结构是许多产业和各类工程学科的理论和技术基础，是造就可纵览技术发展全局人才的摇篮

为了加强专业与特定工程部门的紧密联系，并为我国的国防建设培养高层次人材，2002年开始在工程力学系增设了国防定向的“飞行器设计与工程”专业

2002年开始招收国防定向生

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