南京农业大学外国语学院合作交流据2020年6月学院官网显示，学院与侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆共建省级研究生工作站，2名教授领衔翻译团队，翻译和审校南京大屠杀史料
据2020年6月学院官网显示，近5年，学院邀请来自美英日等专家教授开展短期讲学，选派教师前往英国雷丁大学、考文垂大学和美国佐治亚州立大学进行暑期培训；与英国雷丁大学亨利商学院签署“4+1”合作项目，与日本北陆大学签署“2+2”联合培养项目，与日本千叶大学、宫崎大学和鹿儿岛县立短期大学开展交换生项目
截至2015年5月，学院日语系设有日本国际交流基金项目、国际交流基金日本语教师进修项目、“日本学术振兴会”青年教师研修项目、江苏省与石川县政府日本语教育合作项目等对外交流项目；日语系与日本大和语言教育学院合作，建立了学校第一个海外教学实习基地
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