美国独立学院与大学协会收入与支出NAICU每年收入在600万美元左右
经费主要来源于会费，另外还有会议收入（赞助商）和其他收入
协会2015-2016年的收入为620万美元，其中580万美元（超过93%）来自会费
协会2015年4月的报告显示，约75个机构支付最低会费（600美元），约135个机构支付最高会费（14500美元），约700所学院和大学支付平均会费（约5700美元）
支出方面，协会的年均支出大约为500～600万美元
按照每年的财政预算和实际情况进行拨款
支出主要包括人员薪酬和业务费用
人员薪酬包括工资、福利、所得税，占支出的70%以上
业务费用包括顾问/外部服务费、年会费、会议费和旅费、办公室业务费用和电脑/数据服务费等
同时，协会设立了特别项目或活动支出（超出财政年度运营预算或影响多个财政年度的特殊支出）
例如，2007年11月16日，董事会批准的特别项目基金（20万美元）用于高校信息网开支等
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