中国科学院微生物研究所教学建设据2016年4月研究所官网显示，中国科学院微生物研究所共有在学研究生513人，在站博士后57人
国家、中国科学院大学、微生物研究所各级奖学金及资助奖学金来源奖学金名称国家国家奖学金、博士研究生学术新人奖、发展研究奖学金中国科学院大学院长奖、朱李月华优秀博士生奖、宝洁优秀研究生奖学金、地奥奖学金、保罗生物科技优秀学生奖、BHPB奖学金、大学生奖学金北京生命科学研究院“Johnson&Johnson Asia Outstanding Garduate Thesis Avard in Bio-tech"奖和亚洲杰出研究生和优秀研究生奖、赛诺菲巴斯德生物医学杰出研究生奖中国科学院微生物研究所优秀研究生奖学金、所长奖学金、各研究室奖学金据2016年4月研究所官网显示
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