中国科学院遗传与发育生物学研究所合并发展根据中国科学院知识创新工程全面推进阶段北京生命科学研究基地建设的总体部署，2001年，经中国科学院党组研究决定并报中央机构编制委员会批准，将遗传研究所与发育生物学研究所整合，组建了中国科学院遗传与发育生物学研究所
2002年，中国科学院又将原石家庄农业现代化研究所并入新组建的遗传与发育生物学研究所（简称遗传发育所）
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