中国科学院水生生物研究所院所标识所徽中国科学院水生生物研究所的所徽由抽象的水生动物、水生植物组成的“水生”字样及中国科学院水生生物研究所中、英文名称组成，该徽既是水生所名称的代表，又简单地概括了水生所的研究领域
图案中左侧“SSS”既是汉字“水”的象形写法，也是“水生所”汉语拼音（Shui Sheng Suo）的字首字母，同时又象征着水生所科技工作者所踏遍的江河，最左边的“S”与左下方黑点及圆的边缘一起，组成一“鱼”形，又象水中的低等生物；右侧的植物形象组成“生”字，也代表了水生所在植物学领域的研究工作
“水”和“生”所代表的生物之间相互连接，象征着水生所多学科的综合优势以及各学科之间的有机融合
有水有草，生物多样，也正是水生所广大科技工作者多年奋斗的目标——和谐平衡的水生生态环境
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