中国科学院化学研究所科研部门截至2020年12月31日，化学所有3个国家重点实验室，9个中国科学院重点实验室，1个分析测试中心，还有与北京大学共同组建的北京分子科学国家研究中心
国家重点实验室：高分子物理与化学国家重点实验室、分子反应动力学国家重点实验室、分子动态与稳态结构国家重点实验室 中国科学院重点实验室：胶体、界面与化学热力学院重点实验室、分子纳米结构与纳米技术院重点实验室、光化学院重点实验室、有机固体院重点实验室、工程塑料院重点实验室、分子识别与功能院重点实验室、活体分析化学院重点实验室、绿色印刷院重点实验室、极端环境高分子材料重点实验室
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