中国科学院生态环境研究中心学科建设根据2021年9月官网显示，中国科学院生态环境研究中心设有二级学科博士点6个、二级学科硕士点6个以及专业学位硕士点2个，设有环境科学与工程、生物学、生态学博士后流动站
同时，中心还是中国科学院博士研究生教育重点培养基地，“环境科学与工程”流动站为全国优秀博士后流动站
学术学位授权二级学科博士点（6个）：环境科学、环境工程、生态学、分析化学、有机化学、环境经济与环境管理 学术学位授权二级学科硕士点（6个）：环境科学、环境工程、生态学、环境经济与环境管理学、分析化学、有机化学专业学位二级学科硕士点（2个）：环境工程、生物工程 博士后科研流动站（3个）：环境科学与工程、生物学、生态学
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