中国科学院合肥物质科学研究院学术期刊据2016年7月研究院官网信息显示，由该研究院各科研机构出版、对外公开发行的学术刊物有《等离子体科学和技术（英文版）》、《量子电子学报》、《大气与环境光学学报》、《模式识别与人工智能》、《国际信息获取学报（英文版）》等
《等离子体科学和技术（英文版）》《等离子体科学和技术（英文版）》创刊于1999年，由中国科学院等离子体物理研究所和中国力学学会共同主办，涵盖的领域包括基础等离子体现象、低温等离子体、磁约束等离子体、惯性约束等离子体、天体物理及空间等离子体、和它们之间的交叉科学、以及在工程技术方面的发展应用；2003年被美国科学引文索引（SCI）收录，2006年被美国工程索引（EI）收录，2006年与英国物理学会出版社（IOPP）合作，由IOPP负责期刊的海外发行
《量子电子学报》《量子电子学报》1984年创刊，由中国科学院主管，中国光学学会基础光学专业委员会、中国科学院合肥物质科学研究院主办，主要刊登光学、激光以及光学的电子学交叉学科等量子电子学领域具有创新意义的研究成果
该刊物曾多次获“中国光学期刊”、“华东地区优秀期刊”及、“安徽省优秀期刊” 奖；已被《科学文摘》（SA）、《化学文摘》（CA）以及《中国科学引文数据库》、《中国期刊网》等收录
《大气与环境光学学报》《大气与环境光学学报》2006年创刊，是由中国科学院安徽光学精密机械研究所主办的学术刊物
主要报道国内外大气光学和环境光学领域基础研究和应用基础研究方面的最新进展与成果，重点栏目为进展与综述、大气光学、环境光学、环境光谱学、遥感、海洋光学、空间光学等
该刊已被英国《科学文摘》、美国《化学文摘》以及中国国内相关数据库收录
《模式识别与人工智能》《模式识别与人工智能》1989年创刊，是由中国自动化学会、国家智能计算机研究开发中心和中国科学院合肥智能机械研究所共同主办、科学出版社出版的学术性期刊
该刊主要发表和报道模式识别、人工智能、智能系统等方面的研究成果与进展，被《中文核心期刊要目总览》收为自动化技术、计算机技术领域核心刊物，被美国工程信息公司（Ei）收为Ei Page One数据库收录期刊，被《中国科学引文数据库》列为来源期刊及统计源，为《中国学术期刊文摘》引用期刊
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