中国科学院海洋研究所设备资源设备设施根据2015年10月研究所官网显示，中国科学院海洋所拥有科学考察船3艘：“科学一号”轮、“科学三号”轮、“创新”轮
全所科研装备超过7000台（套），总价值1.6亿元人民币，其中专用设备2600余台（套），价值1.2亿元人民币；通用设备超过4000台（套），价值4500万元人民币；其中海洋观测设备1600余台（套），价值1.2亿元人民币；室内分析测试设备1000多台（套），价值6600万元人民币
馆藏资源根据2015年10月研究所官网显示，研究所图书馆馆藏图书15.6万册，中外期刊1000余种，与46个国家和地区的270多个机构交换原版书刊300多种
同时，研究所还具有亚洲规模最大的中国科学院海洋生物标本馆
馆藏海洋生物标本67万余号，其中模式标本1100种共2300号
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