中国人民解放军军事医学科学院科研部门截至2011年8月，军事医学科学院有各类重点实验室21个，研究中心9个，科技平台1个；有国家重点实验室3个，国家工程实验室1个，国家工程研究中心4个，解放军重点实验室10个，天津市工程中心1个，天津市重点实验室1个

国家重点实验室：病原微生物生物安全国家重点实验室、蛋白质组学国家重点实验室国家工程实验室：哺乳动物细胞高效表达国家工程实验室国家工程研究中心：国家生物防护装备工程中心、国家应急药物工程技术研究中心、国家生物防护装备工程技术研究中心、蛋白质药物国家工程研究中心解放军重点实验室：解放军军事环境医学重点实验室、解放军卫生装备技术重点实验室、解放军生物防御重点实验室、解放军重要疾病防控模式生物重点实验室、解放军生物武器损伤防治药物重点实验室、解放军血液安全与保障重点实验室、解放军干细胞与再生医学重点实验室、解放军核化损伤救治重点实验室、解放军再生医学与干细胞研究重点实验室、解放军血液安全与保障重点实验室天津市工程中心：天津市卫生学环境医学技术工程中心天津市重点实验室：天津市环境与食品安全风险监控技术重点实验室类别名称直属单位卫生勤务与医学情报研究所放射与辐射医学研究所基础医学研究所卫生学环境医学研究所微生物流行病研究所毒物药物研究所野战输血研究所疾病预防控制所卫生装备研究所生物工程研究所军事兽医研究所医院解放军医学图书馆实验动物中心实验仪器厂重点实验室蛋白质工程实验室生物化学实验室生物芯片实验室蛋白质组与基因组学实验室分子遗传学实验室军事毒理学实验室媒介生物学实验室微生物检测实验室卫生装备技术实验室军事应激医学实验室新武器效应与防护实验室分子免疫学实验室实验血液学实验室新药评价实验室国家生物防护装备工程技术研究中心国家实验灵长类种质资源中心蛋白质药物国家工程研究中心国家药品临床研究基地蛋白质组学国家重点实验室病原微生物生物安全国家重点实验室军事医学科学院药代动力学重点实验室研究中心国家生物防护装备工程技术研究中心国家实验灵长类种质资源中心蛋白质药物国家工程研究中心国家药品临床研究基地国家消毒检测评价中心国家艾滋病检测确认实验室国家菌种保藏中心国家北京新药安全评价中心国家生物医学分析中心工程中心军事医学科学院组织工程中心国家生物防护装备工程技术研究中心科技平台军事医学科学院研发实验服务基地资料来源：

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