中国科学院上海药物研究所设施资源馆藏资源截至2015年8月，中国科学院上海药物研究所信息中心年订购和交换的外文现刊保持在200多种，可提供全文的外文电子期刊5800多种、中文电子期刊8000多种

拥有专业数据库90多个，形成覆盖药物设计与发现、临床前研究、临床研究、中试生产、注册上市、安全监管等药物研发各阶段，以药物化学、天然产物化学、药理学、毒理学、分子生物学、细胞生物学及相关专业文献为主的资源体系

 仪器设备根据2016年4月研究所官网显示，上海药物所公共技术服务中心管理的仪器设备有45台，原值近7302万元

 部分仪器设备
名称所属部门nano-LC LTQ-Orbitrap质谱仪质谱服务部Q-TOF 质谱仪 （ESI-HR）质谱服务部LTQ 线性离子阱质谱仪器质谱服务部DFS 磁质谱仪器质谱服务部三重四级杆串联液质联用仪质谱服务部LCQ-DECA 离子阱质谱仪质谱服务部600 兆 LC-SPE NMR（Cryo）联用仪核磁技术服务部600 兆核磁共振谱仪 （低温探头）核磁技术服务部500 兆核磁共振谱仪核磁技术服务部400 兆核磁共振谱仪核磁技术服务部400-MR 核磁共振谱仪核磁技术服务部400-Plus 核磁共振谱仪核磁技术服务部300-Plus 核磁共振谱仪核磁技术服务部资料来源：  

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