中国科学院上海药物研究所文化传统所徽中国科学院上海药物研究所标识如右图所示：释义：1.标识以象征生命的绿色为基础，以药物研究所化学、生物学两大学科以及实验技术为要素，以中国书法的用笔为表现形态，主要含义：2.构图两侧呈环形运动状，象征在药物研究领域化学与生物学的不断发展与融合
3.环形两叶互补，叠化出烧杯形状，并在中央形成水滴状，代表了实验技术，寓意药物研究有效成分的发现与研究
4.用中国书法的流畅与动感构成图案，象征中国传统中药与现代科学技术的结合以及提高中国自主知识产权的创新药物研究的信心与能力
5.以抽象的构图，赋予标识丰富的内涵与想象，与药物所悠久的历史相呼应，且简洁而富有时代感，具有较强的个性
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