中国农业科学院上海兽医研究所人员编制据2017年12月研究所官网显示，研究所共有在职职工124名，其中科研人员89名，管理人员19人，支撑和服务人员26人，研究员20名，副研究员27名，具有博士、硕士学位的占科研人员的84%；入选人事部百千万工程和神农计划2人，中华农业英才奖获得者1人，上海市十大科技精英获得者1人，全国农业科研杰出人才2人，国务院政府特贴专家3人，中国农业科学院杰出岗位人才15人（一、二、三级），省部级中青年专家5人，上海市领军人才3人，闵行区拔尖人才和领军人才21人

 百千万人才工程：童光志神农计划：童光志中华农业英才奖获得者：童光志全国农业科研杰出人才：李泽君 等农业部有突出贡献中青年专家：童光志、周金林 国务院政府特殊津贴获得者：童光志 、薛飞群 等创新团队列表
创新团队名称首席科学家动物血吸虫病团队程国锋动物原虫病团队周金林猪病毒性繁殖障碍综合症团队童光志猪呼吸道传染病团队马志永水禽病毒病团队丁铲兽用抗感染药物团队薛飞群畜禽细菌性传染病团队于圣青动物流感病毒病原生态学团队李泽君动物源性病原生物学与食品安全团队陈兆国小动物传染病预防与控制团队刘光清 

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