中国农业科学院上海兽医研究所设备资源仪器设备据2017年12月研究所官网显示，研究所中心仪器室管理的仪器设备近50台，其中20万元以上的大型设备34台，包括电镜、流式细胞仪、共聚焦显微镜等价值百万元以上的超大型设备8台；拥有大小实验室8个，总面积近400平方米，按功能划分为分子生物学平台区、蛋白质组学区、电镜室、流式细胞室、离心机室、制备室等六个区

 数据库资源据2017年12月研究所官网显示，研究所开通了中国知网（CNKI数据库）、万方数据资源、国研网、ScienceDirect、SpringerLink、Wiley Online Library、Nature Publishing Group（NPG）、Annual Reviews、Oxford University Pess Journals（OUP）、Cambridge University Pess Journals（CUP）、ASM、Taylor & Francis、PNAS、ACS、Poultry Science Association（PSA）、Springer Protocols、Web of Science、Science Online、ProQuset博硕士学位论文全文数据库等科技文献数据库

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