中国农业科学院植物保护研究所合作交流据2016年11月研究所官网显示，在国际合作平台建设方面，拥有2个联合实验室，即“农业部-国际应用生物科学中心生物安全联合实验室”和“中美生物防治联合实验室”；2个国家外专局引智基地，即“绿僵菌生物防蝗基地”和“无公害微生物农药生产应用技术基地”，并于2012年在科技部国际合作基地命名中被授予“国家农业生物安全国际联合研究中心”称号

 据2016年11月研究所官网显示，研究所先后与美国、加拿大、墨西哥，荷兰、俄罗斯、比利时、丹麦、瑞士、挪威、英国、意大利、德国、西班牙、哈萨克斯坦，澳大利亚，韩国、日本、蒙古、越南、老挝、柬埔寨、缅甸、泰国、朝鲜等国家有关农业科研教学单位，与国际应用生命科学研究中心（CABI）、国际小麦玉米改良中心（CIMMYT）、国际原子能组织（IAEA）、国际水稻所（IRRI）、联合国工业发展组织（UNIDO）等国际组织，与孟山都、先锋、先正达等大型跨国公司等近30个国家和国际组织的50余个农业科研机构和大学建立了合作伙伴关系

 据2016年11月研究所官网显示，研究所每年，接待来访国外专家50余个团组、150人次，邀请国外专家作学术报告40-50次；选派出访专家40余个团组、70余人次参加国际会议、合作研究和交流培训等国际交流与合作，有多人次受邀在国际学术会议做特邀或大会报告；主办或承办国际大会、地区性和双边国际学术交流会议10次；研究所专家在国际学术组织和学术期刊任职20余人次

 据2016年11月研究所官网显示，研究所在引进国外智力资源方面，与多名专家签署长期客座教授协议：美国科罗拉多州立大学Jan Leach教授、美国杜克大学董欣年教授、比利时列日大学Frederic Francis教授、丹麦奥胡斯大学Gabor Lovei教授、英国洛桑研究所周警疆博士、美国迈阿密大学梁春教授、英国苏塞克斯大学Neil Crickmore教授、法国农业科学院Didier Lereclus教授、CABI瑞士中心主任Ulrich Kuhlmann博士和CABI北京代表处张峰博士

Gabor Lovei教授和Jan Leach教授分别入选国家外专局2011，2012-2013年高端外国专家项目计划；CABI瑞士中心主任Ulrich Kuhlmann博士获得2012年中国政府“友谊奖”

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