中国农业科学院棉花研究所科研成果截至2016年，中国农业科学院棉花研究所主持或参加研究项目（专题）近300项，获省部级以上成果奖励66项，其中国家级奖22项，一等奖4项：抗病高产优质棉花新品种中棉所12获得国家技术发明一等奖，全国棉花品种区域试验、适合麦棉两熟夏套棉花新品种中棉所16和高产优质多抗棉花新品种中棉所19分别获得国家科技进步一等奖

 先后获得奖项122项，其中国家级22项，省部级52项，中国农科院32项，行业奖11项，地市级5项； 育成品种102个，其中棉花品种89个，小麦品种13个； 获得专利104项，其中发明专利76项，实用新型专利28项

 中国农业科学院棉花研究所获得一等奖一览表成果名称获奖年度获奖名称获奖经历抗病高产优质棉花新品种中棉121990国家技术发明奖1989农业部科技进步一等奖高产优质多抗棉花新品种中棉所191998国家科技进步奖1997农业部科技进步一等奖适合麦棉两熟夏套棉花新品种——中棉所161995国家科技进步奖1993农业部科技进步一等奖全国棉花品种区域试验及其结果应用1985国家科技进步奖--------中国农业科学院棉花研究所获得二等奖一览表成果名称获奖年度获奖名称获奖经历棉花组织培养性状纯化及外源基因功能验证平台构建2010国家技术发明奖------高效广适双价转基因抗虫棉中棉所412009国家科技进步奖2007神农中华农业科技奖二等奖2006陕西省科学技术一等奖2006中国农科院科技成果一等奖野生与特色棉花遗传资源的创新与利用研究2006国家科技进步奖2005河南省科技进步二等奖高产优质多抗广适棉花杂交种——中棉所29选育及推广应用2006国家科技进步奖2004中国农科院科技进步一等奖2004农业部农牧渔业丰收一等奖2005河南省科技进步一等奖棉花规模化转基因技术体系平台建设及其应用2005国家科技进步奖2003河南省科技进步一等奖生化辅助育种技术选育优质、多抗丰产系列棉花新品种——中棉所24、27和362004国家科技进步奖中棉所24获2002中国农科院科技一等奖中棉所24获2002农牧渔业丰收奖三等奖中棉所27获2003中国农科院科技成果一等奖适合麦棉两熟的夏套低酚棉花新品种——中棉所201999国家科技进步奖1998农业部科技进步一等奖适于麦棉套种的棉花新品种中棉所171996国家科技进步奖1994农业部科技进步一等奖全国不同生态区优质棉高产技术研究与应用1993国家科技进步奖1992农业部科技进步一等奖中国亚洲棉性状研究及其利用1989国家科技进步奖1988农业部科技进步一等奖控制棉花主要病虫综合防治对策及关键技术1988国家科技进步奖1986农业部科技进步二等奖中国农业科学院棉花研究所获得三等奖一览表成果名称获奖年度获奖名称获奖经历黄淮地区棉麦高产综合技术研究与示范1996国家科技进步奖1994农业部科技进步二等奖河南省盐碱地植棉增产技术开发研究1988国家科技进步奖1986河南省科技进步二等奖棉花品种资源开发与利用1987国家科技进步奖1985农业部科技进步二等奖亚洲棉(A)与比克氏棉(G)人工合成[AG]复合染色体组新棉种研究1995国家技术发明奖1994山西省科技成果理论一等奖中国农业科学院棉花研究所获国家星火奖成果名称获奖年度获奖名称棉花良种繁育新体制1992国家星火奖中国农业科学院棉花研究所获全国科学大会奖成果名称获奖年度获奖名称获奖经历棉花枯萎病综合防治研究1978全国科学大会奖1978河南科学大会奖棉花良种“中棉3号”1978全国科学大会奖1978河南科学大会奖（备注：以上获奖信息参考资料来源 ）

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