中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所科研部门根据2016年9月研究所官网显示，该所有依托自身建成的各类科技平台19个

其中国家级科研基地2个，国家级研究室1个，农业部级重点实验室2个，农业部级检验测试中心1个，农业部级野外科学观测试验站1个，省级重点实验室2个，省级研究中心2个，中国农业科学院级研究中心3个，中国农业科学院级研究中心1个，中国农业科学院级科学观测试验站3个

 国家级科研基地（2个）：国家农业科技创新与集成示范基地、国家旱生牧草驯化繁育基地 国家级研究室（1个）：国家奶牛技术体系疾病控制研究室 农业部级重点实验室（2个）：农业部兽用药物创制重点实验室、农业部畜产品质量安全风险评估实验室 农业部级检验测试中心（1个）：农业部动物毛皮及制品质量监督检验测试中心（兰州） 农业部级野外科学观测试验站（1个）：农业部兰州黄土高原生态环境重点野外科学观测试验站 省级重点实验室（2个）：甘肃省牦牛繁育工程重点实验室、甘肃省新兽药工程重点实验室 省级研究中心（2个）：甘肃省新兽药工程研究中心、甘肃省中兽药工程技术研究中心 中国农业科学院级研究中心（3个）：中国农业科学院临床兽医研究中心、中国农业科学院羊育种工程技术中心、中国农业科学院兰州畜产品安全风险评估研究中心 中国农业科学院级研究中心（1个）：中国农业科学院新兽药重点工程开放实验室 中国农业科学院级科学观测试验站（3个）：中国农业科学院黄土高原生态环境重点野外科学观测试验站、中国农业科学院兰州农业科学观测试验站、中国农业科学院张掖牧草及生态农业野外科学观测试验站 

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